W 2006 r. została ukończona inwestycja firmy Wawel SA w Dobczycach, związana z realizacją planów strategicznych firmy, obejmujących przeniesienie produkcji do nowego zakładu. Na blisko 6 ha działce w Strefie Przemysłowej w Dobczycach, przy ulicy Towarowej 6, powstał nowoczesny zakład spełniający wszelkie standardy wymagane przy produkcji żywności.

Cały proces inwestycyjny trwał od czerwca 2004 roku i obejmował m.in. budowę nowoczesnej hali produkcyjnej wraz z montażem i uruchomieniem wszystkich linii produkcyjnych, budowę magazynu surowców wyposażonego w narzędzia ułatwiające rozładunek surowców oraz ich transport na halę produkcyjną, magazynu dystrybucyjnego z całym zapleczem logistycznym, komputerowym śledzeniem partii, systemem wysokiego składowania itp. Koszt całej inwestycji wyniósł ponad 100 milionów złotych.

Aby nie zawieść oczekiwań smakoszy cukierków orzechowych czy raczków cenionych m.in. za niepowtarzalne nadzienie grylażowe z cieniutkimi niteczkami karmelu, do Dobczyc zostały również przeniesione maszyny, które pozwalają na produkowanie cukierków metodą tradycyjną.

Zakład w Dobczycach został zaprojektowany i zrealizowany w sposób spełniający wszelkie standardy ochrony środowiska. Między innym wyposażony został w nowoczesne systemy zabezpieczające przed niekontrolowanym wydostaniem się zanieczyszczeń do otoczenia. Ograniczenie emisji hałasu, zużycia wody i energii czyni zakład przyjaznym dla środowiska.

Główna siedziba WAWEL SA mieści się dzisiaj w Krakowie na ulicy Władysława Warneńczyka 14. Obecnie w centrali oraz fabryce  pracuje ponad 700 osób.